Điều trị viêm dạ dày bằng thuốc cho hiệu quả nhanh chóng và tiện lợi nên được sử dụng rất phổ biến hiện nay. Tùy thuộc vào tình trạng của người bệnh mà bác sĩ có thể có các chỉ định sử dụng thuốc khác nhau. Những nhóm thuốc được sử dụng phổ biến hiện nay như thuốc kháng acid, thuốc ức chế bơm proton,...