Quá trình điều trị bệnh tay chân miệng phức tạp do bệnh có thể biểu hiện nhiều mức độ khác nhau, các chỉ định điều trị phải thay đổi phù hợp với mức độ bệnh. Do đó, người bệnh không nên tự ý điều trị bệnh tại nhà để phòng tránh các biến chứng nguy hiểm của bệnh.