Đối với mỗi giai đoạn, bác sĩ sẽ điều trị ung thư thực quản theo nhiều phác đồ khác nhau. Bên cạnh đó, phương pháp điều trị cũng tùy vào tình trạng bệnh, thể trạng bệnh nhân và mức độ phát triển của tế bào ung thư.
Sau khi được điều trị, bệnh ung thư thực quản vẫn có khả năng tái phát và xuất hiện trở lại. Do vậy người bệnh cần được theo dõi chặt chẽ để phát hiện sớm tình trạng tái phát ung thư thực quản.