Suy dinh dưỡng thấp còi khi không được quan tâm đúng mức và xử lý kịp thời có thể gây nhiều hậu quả như chậm phát triển thể chất và trí tuệ, giảm đề kháng,... Những hậu quả của suy dinh dưỡng thấp còi gây ra có thể tồn tại rất lâu kể cả khi trẻ đã không còn suy dinh dưỡng.