Phẫu thuật là phương pháp điều trị viêm khớp dạng thấp được lựa chọn khi điều trị bảo tồn không có tác dụng hoặc bệnh quá nặng. Hiện nay có nhiều phương pháp phẫu thuật viêm khớp dạng thấp khác nhau như phẫu thuật thay khớp, phẫu thuật chỉnh trục, phẫu thuật sửa gân, phẫu thuật nội soi khớp,...