Khi bị nhiễm trùng, đau mắt đỏ (viêm kết mạc) ở trẻ sơ sinh có thể rất nghiêm trọng trong đó có biến chứng đau mắt đỏ gây viêm màng não ở trẻ sơ sinh có thể gây nguy hiểm cho bệnh nhi.
Hầu hết các trường hợp đau mắt đỏ đều tương đối nhẹ và không gây tổn thương cho mắt và thị lực về sau của người bệnh. Tuy nhiên trong một số trường hợp, một số biến chứng đau mắt đỏ có thể trở nên trầm trọng, thậm chí đe dọa tính mạng người bệnh.